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Analisi di arricchimento di insiemi genici assistita da machine learning

L'analisi di arricchimento di insiemi genici assistita da machine learning (ML-GSEA) estende il framework classico GSEA incorporando modelli di ML supervisionati o non supervisionati — come foreste casuali, reti neurali o architetture di deep learning — per migliorare il rilevamento, la classificazione e l'interpretazione biologica degli insiemi genici arricchiti da dati di espressione high-throughput. L'approccio è particolarmente prezioso per relazioni tra insiemi genici complesse e non lineari che le statistiche classiche di arricchimento potrebbero trascurare.

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Fonti

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102
  2. Ma, J., Yu, M. K., Fong, S., Ono, K., Sage, E., Demchak, B., Sharan, R., & Ideker, T. (2018). Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell. Nature Methods, 15(4), 290–298. DOI: 10.1038/nmeth.4627

Come citare questa pagina

ScholarGate. (2026, June 3). Machine Learning-Assisted Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/machine-learning-assisted-gene-set-enrichment-analysis

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ScholarGateMachine learning-assisted gene set enrichment analysis (Machine Learning-Assisted Gene Set Enrichment Analysis). Consultato il 2026-06-17 da https://scholargate.app/it/bioinformatics/machine-learning-assisted-gene-set-enrichment-analysis · Insieme di dati: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026