Analisi differenziale di RNA-seq a singola cellula

L'analisi differenziale di RNA-seq a singola cellula (scRNA-seq) è una pipeline computazionale che confronta i profili trascrittomici tra condizioni biologiche — come trattato versus non trattato, malato versus sano, o punti temporali — a risoluzione di singola cellula. Identifica quali geni, tipi cellulari e stati cellulari cambiano tra le condizioni, fornendo intuizioni meccanicistiche che i confronti di RNA-seq bulk non possono offrire. L'approccio combina clustering, annotazione dei tipi cellulari e test statistici, utilizzando tipicamente l'aggregazione pseudobulk per tenere conto della correlazione intra-campione.