Analisi di RNA-seq unicellulare di serie temporali — Trascrittomica temporale a risoluzione unicellulare
L'analisi di RNA-seq unicellulare di serie temporali cattura l'espressione genica attraverso molteplici punti temporali a risoluzione unicellulare per rivelare come le popolazioni cellulari emergono, transitano e divergono durante processi biologici dinamici quali sviluppo, differenziazione o progressione di malattia. Combinando l'ordinamento in pseudotempo, la velocità dell'RNA e il test di dinamiche differenziali, i ricercatori ricostruiscono la traiettoria temporale delle singole cellule e identificano le modifiche regolatrici geniche che guidano le transizioni biologiche.
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Fonti
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/it/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
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