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経路濃縮解析 — 生物学的経路濃縮解析
経路濃縮解析（PEA）は、関心のある遺伝子またはタンパク質のリスト（通常は差次的発現またはプロテオミクス実験から得られる）を受け取り、定義済みの生物学的経路または機能的遺伝子セットが偶然期待されるよりも多く含まれているかどうかを特定する統計的手法である。KEGG、Gene Ontology、Reactomeなどのキュレーションされた経路知識ベースに個々の分子変化をマッピングすることにより、PEAは長い遺伝子リストを解釈可能な生物学的プロセスに変換し、ハイスループットオミクス実験の後解析における中心的なツールとなっている。
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出典
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis
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