Process / pipelineBioinformatics / omics
時系列経路濃縮解析 — 時間経過に伴う動的な経路活性
時系列経路濃縮解析は、順序付けられた時間点全体で遺伝子活性が協調的に変化する生物学的経路を特定します。各時間点を独立に扱うのではなく、この手法は各経路内の遺伝子発現の時間的軌跡をモデル化し、個々の遺伝子だけでなく、生物学的プログラム全体が時間依存的に活性化または抑制されているかどうかをテストします。これは発生生物学、薬物応答研究、感染症の時間経過研究で広く使用されています。
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出典
- Ernst, J., Nau, G. J., & Bar-Joseph, Z. (2005). Clustering short time series gene expression data. Bioinformatics, 21(Suppl 1), i159–i168. link ↗
- Cheng, J., Tegge, A. N., & Bhatt, D. L. (2014). A method for identifying and interpreting time-series pathway activity changes from gene expression data. Bioinformatics, 30(21), 3147–3154. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-pathway-enrichment-analysis
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