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単一細胞RNAシーケンス（scRNA-seq）差次的発現解析
単一細胞RNAシーケンス（scRNA-seq）差次的発現（DE）解析は、個々の細胞の定義されたグループ間、例えば細胞種、疾患状態、または処置条件間で、発現レベルが有意に異なる遺伝子を同定する。数百万個の細胞全体のシグナルを平均化するバルクRNAシーケンスとは異なり、scRNA-seq DEは各個々の細胞のトランスクリプトーム上で動作し、細胞集団特異的な遺伝子調節と、一見均一な組織内の不均一性の詳細な特徴付けを可能にする。
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出典
- Butler, A., Hoffman, P., Smibert, P., Papalexi, E., & Satija, R. (2018). Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species. Nature Biotechnology, 36(5), 411–420. DOI: 10.1038/nbt.4096 ↗
- Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. (2014). Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biology, 15(12), 550. DOI: 10.1186/s13059-014-0550-8 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell RNA Sequencing Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/single-cell-rna-seq-differential-expression
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