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差次的エピゲノムワイド関連解析 — 差次的EWAS

差次的エピゲノムワイド関連解析(Differential EWAS)は、ゲノム全体にわたる数十万ものCpGメチル化部位をスキャンし、2つ以上の比較群間(例:疾患群 vs. 対照群、曝露群 vs. 非曝露群、あるいは異なる発達段階)でメチル化レベルが有意に異なる部位を同定する。これは、RNAカウントレベルではなくDNAメチル化マークレベルで動作する、差次的発現解析のエピゲノムにおける標準的な類推である。

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出典

  1. Rakyan, V. K., Down, T. A., Balding, D. J., & Beck, S. (2011). Epigenome-wide association studies for common human diseases. Nature Reviews Genetics, 12(8), 529–541. link
  2. Jaffe, A. E., & Irizarry, R. A. (2014). Accounting for cellular heterogeneity is critical in epigenome-wide association studies. Genome Biology, 15(2), R31. link

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Differential Epigenome-Wide Association Study (Differential EWAS). ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-epigenome-wide-association-study

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ScholarGateDifferential Epigenome-Wide Association Study (Differential Epigenome-Wide Association Study (Differential EWAS)). 2026-06-17に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-epigenome-wide-association-study · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026