Process / pipelineBioinformatics / omics
ネットワークベースのシングルセルRNAシーケンス解析
ネットワークベースのシングルセルRNAシーケンス解析は、シングルセル転写データから分子相互作用ネットワーク（遺伝子制御ネットワーク、共発現ネットワーク、細胞間コミュニケーショングラフなど）を構築・解析することで、標準的なscRNA-seqワークフローを拡張する。このアプローチは、各遺伝子を独立して扱うのではなく、細胞集団内および細胞集団間の遺伝子回路と細胞間シグナル伝達経路の協調的な活動を捉え、シングルセル解像度での転写制御のシステムレベルの視点を提供する。
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出典
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
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