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ベイズ経路富化解析
ベイズ経路富化解析は、定義済みの遺伝子セット（生物学的経路）が、実験において差次的活性を示す遺伝子群の中に系統的に過剰に存在するかどうかを検定する。古典的な過剰表現検定とは異なり、事前の生物学的知識を事前分布としてエンコードし、観測された発現データで更新することで、p値ではなく富化の事後確率を得る。この確率的枠組みは、小標本、複数の経路、および不確実性の伝播を、一貫した統計的枠組みで自然に扱う。
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出典
- Baldi, P., & Long, A. D. (2001). A Bayesian framework for the analysis of microarray expression data: regularized t-test and statistical inferences of gene changes. Bioinformatics, 17(6), 509–519. DOI: 10.1093/bioinformatics/17.6.509 ↗
- Newton, M. A., Quintana, F. A., Den Boon, J. A., Bhattacharya, S., & Ahlquist, P. (2004). Random-set methods identify distinct aspects of the enrichment signal in gene-set analysis. The Annals of Applied Statistics, 1(1), 85–106. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/bayesian-pathway-enrichment-analysis
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