Process / pipelineBioinformatics / omics
ネットワークベースGWAS — ネットワークベース全ゲノム関連解析
ネットワークベースGWASは、従来の全ゲノム関連解析（GWAS）の結果と、タンパク質間相互作用（PPI）ネットワークや遺伝子共発現グラフなどの生物学的ネットワークデータを統合し、疾患関連遺伝子モジュールまたはサブネットワークを同定する。このアプローチでは、個々のトップSNPのみを報告するのではなく、関連シグナルを分子相互作用ネットワーク全体に伝播させ、単一のバリアントがゲノムワイドな有意性に達しなくても、複雑形質生物学に関与している可能性のある遺伝子クラスターを表面化させる。
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出典
- Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-gwas
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