Process / pipelineBioinformatics / omics
時間的単一細胞RNAシーケンス解析 — 単一細胞解像度での時間的トランスクリプトーム
時間的単一細胞RNAシーケンス解析は、複数の時点にわたる遺伝子発現を単一細胞解像度で捉え、発生、分化、または疾患進行などの動的な生物学的プロセス中に細胞集団がどのように出現し、遷移し、分岐するかを明らかにします。擬時間順序付け、RNA速度、および差次的ダイナミクス検定を組み合わせることで、研究者は個々の細胞の時間的軌跡を再構築し、生物学的遷移を駆動する遺伝子調節変化を特定します。
MethodMindで開く近日公開Apply, compare, get guidance
Tools & resources
Learn & explore
動画近日公開
手法の全文を読む
会員限定
ログイン無料アカウントでログインすると、このセクションを読めます。
手法マップ
関連する手法の近傍 — ノードを選択して探索できます。
出典
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
どの手法を選ぶ？
この手法を最も近い類縁の手法と並べ、両者を見比べてください — ライブラリは本を机の上に並べるだけ。選ぶのはあなたです。
- コピー数変異解析バイオインフォマティクス↔ 比較
- eQTL解析バイオインフォマティクス↔ 比較
- 遺伝子セット濃縮解析 (GSEA)バイオインフォマティクス↔ 比較
- 経路濃縮解析バイオインフォマティクス↔ 比較
- RNA-seq 差次的発現バイオインフォマティクス↔ 比較
- Single-cell RNA-seq Analysisバイオインフォマティクス↔ 比較