ネットワークベースの遺伝子セット濃縮分析

ネットワークベースの遺伝子セット濃縮分析（network GSEA）は、古典的なGSEAを拡張したもので、タンパク質間相互作用（PPI）や共発現グラフなどの生物学的相互作用ネットワークを濃縮テストに組み込みます。この手法では、各遺伝子を独立して扱うのではなく、ネットワークのエッジを介して差次的発現シグナルを伝播させ、共調節されている遺伝子や機能的に連結されている遺伝子が遺伝子セットの有意性を共同で支持できるようにします。その結果、経路のトポロジーと遺伝子間依存性を考慮した、生物学的に一貫性のある濃縮スコアが得られます。