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ネットワークベースeQTL解析 — ネットワーク統合型遺伝子発現量的形質座位マッピング

ネットワークベースeQTL解析は、遺伝子変異と発現の関連を遺伝子制御またはタンパク質相互作用ネットワークに埋め込むことで、古典的なeQTLマッピングを拡張するものである。個々のSNP-遺伝子ペアを独立に扱うのではなく、このアプローチは、統計的検出力を向上させ、多重検定の負担を軽減し、遺伝子変異が孤立した転写産物ではなく、制御プログラム全体をどのように摂動させるかを明らかにするために、共発現モジュールや既知の経路構造などのネットワークトポロジーを活用する。

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出典

  1. Skinner, M. E., Uzilov, A. V., Stein, L. D., Mungall, C. J., & Holmes, I. H. (2009). JBrowse: a next-generation genome browser. Genome Research, 19(9), 1630–1638. link
  2. Zhang, B., & Horvath, S. (2005). A general framework for weighted gene co-expression network analysis. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 4(1), Article17. link

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-eqtl-analysis

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ScholarGateNetwork-based eQTL analysis (Network-based Expression Quantitative Trait Loci Analysis). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-eqtl-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026