Process / pipelineBioinformatics / omics

差次的eQTL解析 — 遺伝子発現の文脈依存的遺伝子制御

差次的eQTL解析は、組織型、疾患状態、発生段階、または治療群などの生物学的条件間で系統的に変動する遺伝子発現への制御効果を持つ遺伝子バリアント(発現量的形質遺伝子座; expression quantitative trait loci)を同定する。遺伝子型と条件との間の統計的相互作用を検定することにより、同じ対立遺伝子が文脈に応じて異なる転写結果をもたらす遺伝子座を特定し、条件特異的な遺伝子制御の分子基盤を明らかにする。

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出典

  1. Stranger, B. E., et al. (2007). Relative impact of nucleotide and copy number variation on gene expression phenotypes. Science, 315(5813), 848–853. DOI: 10.1126/science.1136678
  2. Huang, Q. Q., et al. (2018). Dissecting super-enhancer hierarchy based on chromatin interactions. Nature Communications, 9(1), 943. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Differential Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-eqtl-analysis

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ScholarGateDifferential eQTL Analysis (Differential Expression Quantitative Trait Loci Analysis). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/differential-eqtl-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026