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ネットワークベースのRNA-seq差次発現解析
ネットワークベースのRNA-seq差次発現解析は、従来の差次発現検定と、タンパク質間相互作用グラフや重み付き共発現ネットワークなどの遺伝子相互作用ネットワークを統合することで、個々の差次発現遺伝子だけでなく、条件間で共に変化するコヒーレントで生物学的に意味のある遺伝子モジュールを特定します。このアプローチは、偽陽性を大幅に削減し、遺伝子ごとの検定では見えないパスウェイレベルのシグナルを明らかにします。
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出典
- Zhang, B., & Horvath, S. (2005). A general framework for weighted gene co-expression network analysis. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 4(1), Article 17. link ↗
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(Suppl 1), S233–S240. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based RNA Sequencing Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-rna-seq-differential-expression
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