Process / pipelineBioinformatics / omics
マルチオミクス単一細胞RNAシーケンス解析 — 統合的マルチモーダル単一細胞プロファイリング
マルチオミクス単一細胞RNAシーケンス解析は、同じ個々の細胞で同時に測定されるか、または共同でプロファイルされた、2つ以上の分子層(遺伝子発現(scRNA-seq)、クロマチンアクセシビリティ(scATAC-seq)、表面タンパク質存在量(CITE-seq)など)を統合する。これらのモダリティを共有の低次元空間に配置することで、研究者は単一のアッセイでは提供できない、細胞のアイデンティティ、調節状態、表現型に関するメカニズム的に豊かな像を得ることができる。
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出典
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
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