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ネットワークベースの微生物群集多様性解析

ネットワークベースの微生物群集多様性解析は、グラフ理論に基づく共起ネットワーク推論と古典的なアルファおよびベータ多様性指標を統合し、微生物群集の構造的組織を特徴づける。この手法では、分類群を独立した実体として扱うのではなく、ペアワイズの微生物間の関連性をネットワークのエッジとしてモデル化し、単純な多様性指数では検出できないキーストーン分類群、群集モジュール、および生態学的相互作用パターンを特定できるようにする。

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出典

  1. Friedman, J., & Alm, E. J. (2012). Inferring correlation networks from genomic survey data. PLoS Computational Biology, 8(9), e1002687. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002687
  2. Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538–550. DOI: 10.1038/nrmicro2832

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis

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ScholarGateNetwork-based microbiome diversity analysis (Network-Based Microbiome Diversity Analysis). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026