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ネットワークベースの経路エンリッチメント解析
ネットワークベースの経路エンリッチメント解析は、分子相互作用ネットワーク（タンパク質間相互作用、シグナル伝達グラフ、または遺伝子制御ネットワーク）をオミクス測定値と統合して、ある条件下で協調的に変化した生物学的経路を特定する。経路遺伝子を独立したリストとして扱う古典的な過剰濃縮または遺伝子セットエンリッチメントアプローチとは異なり、この手法群はネットワークエッジ全体にシグナルを伝播させ、相互作用のトポロジーを捉え、フラットリストエンリッチメントでは見逃されるような調節異常モジュールを明らかにする。
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出典
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
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