Process / pipelineBioinformatics / omics
Single-cell eQTL Analysis — 細胞型特異的な遺伝子発現の遺伝子制御
Single-cell eQTL解析は、単一細胞RNAシーケンスプロファイルとドナーの遺伝子型データを共同で解析することにより、細胞型特異的な方法で遺伝子発現を制御する遺伝子変異（eQTL）を特定する。バルクeQTL法とは異なり、細胞型が混合された場合に希釈またはマスクされる調節効果を解決し、特定の細胞状態または発達段階に限定された変異の発見を可能にする。
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出典
- Cuomo, A. S. E., et al. (2020). Single-cell RNA-sequencing of differentiating iPS cells reveals dynamic genetic effects on gene expression. Nature Communications, 11(1), 810. link ↗
- Kim-Hellmuth, S., et al. (2020). Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues. Science, 369(6509), eaaz8528. link ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/single-cell-eqtl-analysis
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- ゲノムワイド関連解析 (GWAS)バイオインフォマティクス↔ compare
- 経路濃縮解析バイオインフォマティクス↔ compare
- RNA-seq 差次的発現バイオインフォマティクス↔ compare
- シングルセルGWASバイオインフォマティクス↔ compare
- Single-cell RNA-seq Analysisバイオインフォマティクス↔ compare