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Single-cell RNA-seq Analysis — scRNA-seq
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis は、個々の細胞の解像度で遺伝子発現を特徴づけ、バルクトランスクリプトミクスでは見えない細胞タイプ、状態、および遷移の発見を可能にする。生シーケンスリードから始まり、ワークフローは細胞対遺伝子カウント行列を生成し、品質管理、正規化、次元削減、教師なしクラスタリング、細胞タイプ注釈、および軌道推論や細胞集団間の差次的発現などのさまざまな下流解析へと進む。
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出典
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
このページの引用方法
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
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