ScholarGate
Ассистент
Process / pipelineBioinformatics / omics

Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE) — Транскриптомный анализ ДЭ

Анализ дифференциальной экспрессии (DE) РНК-сек позволяет выявить гены, чья транскрипционная активность значительно отличается между двумя или более биологическими условиями — например, обработанные по сравнению с контролем или больная по сравнению со здоровой тканью. Начиная с необработанных последовательностей, конвейер проходит через выравнивание, нормализацию на основе подсчетов, статистическое моделирование дисперсии подсчетов, проверку гипотез и коррекцию множественного тестирования для получения ранжированного списка дифференциально экспрессируемых генов, сопровождаемого оценками кратного изменения и скорректированными p-значениями.

Открыть в MethodMindСкороВидеоСкороDownload slides

Читать метод полностью

Только для участников

Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.

Войти

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)
Вызов пиков ChIP-seqАнализ обогащения генных…Анализ обогащения сигнал…Выравнивание последовате…Анализ одноклеточной РНК…Вызов вариантовБайесовский анализ eQTLБайесовский анализ обога…Байесовский метаболомный…Байесовский протеомный а…

+50 more

Источники

  1. Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. (2014). Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biology, 15(12), 550. DOI: 10.1186/s13059-014-0550-8 ↗
  2. Robinson, M. D., McCarthy, D. J., & Smyth, G. K. (2010). edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data. Bioinformatics, 26(1), 139–140. DOI: 10.1093/bioinformatics/btp616 ↗

Как цитировать эту страницу

ScholarGate. (2026, June 3). RNA Sequencing Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/rna-seq-differential-expression

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side →

Упоминается в

Байесовский анализ eQTLБайесовский анализ обогащения генных наборовБайесовский метаболомный анализБайесовский протеомный анализБайесовский дифференциальный анализ экспрессии РНК-секвенированияБайесовское выравнивание последовательностейБайесовский вызов вариантовВызов пиков ChIP-seqАнализ вариаций числа копийДифференциальный анализ пиков ChIP-seqДифференциальное эпигеном-широкомасштабное ассоциативное исследованиеДифференциальный анализ eQTLДифференциальный метаболомный анализДифференциальный анализ обогащения путейДифференциальный анализ РНК-сек в одиночных клеткахДифференциальный поиск вариантовeQTL АнализАнализ обогащения генных наборов (GSEA)Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Вызов пиков ChIP-seq с помощью машинного обученияАнализ eQTL с использованием машинного обученияГенно-сетевой анализ обогащения с использованием машинного обученияМашинное обучение для анализа разнообразия микробиомаАнализ дифференциальной экспрессии РНК-сек с помощью машинного обученияАнализ одноклеточной РНК-секвенирования с использованием машинного обученияАнализ метаболомаМультиомиксный анализ eQTLМультиомиксный анализ обогащения генных наборовМультиомный метаболомный анализМультиомиксный протеомный анализАнализ одноклеточной РНК-секвенирования с использованием мультиомикиСетевое эпигеномное исследование ассоциаций (Network EWAS)Сетевой анализ eQTLСетевой анализ обогащения генных наборовСетевой анализ разнообразия микробиомаСетевой анализ дифференциальной экспрессии РНК-секСетевой анализ РНК-секвенирования единичных клетокСетевой вызов вариантовАнализ обогащения сигнальных путейФилогенетический анализПротеомикаВыравнивание последовательностейАнализ eQTL на уровне одиночных клетокОдноклеточный анализ обогащения генных наборовОдноклеточный GWASАнализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Анализ дифференциальной экспрессии генов в одноклеточной РНК-секвенированииВыравнивание одноклеточных последовательностейПиковое профилирование хроматина во времени методом ChIP-seqАнализ вариаций числа копий во времениTime-series Epigenome-wide Association StudyАнализ обогащения генных наборов во времениАнализ временных рядов разнообразия микробиомаАнализ обогащения путей временных рядовВременной филогенетический анализАнализ протеомики временных рядовДифференциальная экспрессия РНК-сек в динамикеАнализ одноклеточной РНК-секвенировки временных рядовВыявление вариантов временных рядовВызов вариантов

Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →

ScholarGate — RNA-seq Differential Expression (RNA Sequencing Differential Expression Analysis). Получено 2026-06-15 из https://scholargate.app/ru/bioinformatics/rna-seq-differential-expression · Набор данных: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026