Анализ временных рядов разнообразия микробиома — Лонгитюдный анализ разнообразия микробиома
Анализ временных рядов разнообразия микробиома отслеживает, как богатство, равномерность и состав сообщества микробных сообществ изменяются в течение нескольких временных точек у одних и тех же субъектов. Объединяя стандартные метрики разнообразия с лонгитюдными статистическими моделями, он отделяет истинную временную динамику от межсубъектной вариации, определяя, когда и как возмущения, такие как изменения диеты, антибиотикотерапия или начало заболевания, изменяют микробиом.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869 ↗
- Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ многоомиксного разнообразия микробиомаБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
- Дифференциальная экспрессия РНК-сек в динамикеБиоинформатика↔ сравнить
Similar methods
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →