ScholarGate
Ассистент
Process / pipelineBioinformatics / omics

Анализ временных рядов разнообразия микробиома — Лонгитюдный анализ разнообразия микробиома

Анализ временных рядов разнообразия микробиома отслеживает, как богатство, равномерность и состав сообщества микробных сообществ изменяются в течение нескольких временных точек у одних и тех же субъектов. Объединяя стандартные метрики разнообразия с лонгитюдными статистическими моделями, он отделяет истинную временную динамику от межсубъектной вариации, определяя, когда и как возмущения, такие как изменения диеты, антибиотикотерапия или начало заболевания, изменяют микробиом.

Открыть в MethodMindСкороApply, compare, get guidance
Tools & resources
Скачать слайды
Learn & explore
ВидеоСкоро

Читать метод полностью

Только для участников

Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.

Войти

Карта метода

Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.

Источники

  1. Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature Methods, 13(7), 581–583. DOI: 10.1038/nmeth.3869
  2. Chen, Y., Lun, A. T. L., & Smyth, G. K. (2023). Differential abundance testing on single-cell data using quasi-likelihood methods. Genome Biology, 24(1), 188. link

Как цитировать эту страницу

ScholarGate. (2026, June 3). Longitudinal Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis

Какой метод?

Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.

Сравнить рядом
ScholarGateTime-series microbiome diversity analysis (Longitudinal Microbiome Diversity Analysis). Получено 2026-06-17 из https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-microbiome-diversity-analysis · Набор данных: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026