Байесовское выравнивание последовательностей — вероятностное выравнивание с квантификацией неопределенности

Байесовское выравнивание последовательностей рассматривает выравнивание биологических последовательностей (ДНК, РНК или белка) как задачу вероятностного вывода, а не как детерминированную оптимизацию. Вместо того чтобы возвращать единственное наилучшее выравнивание, оно производит выборку из апостериорного распределения по всем правдоподобным выравниваниям, учитывая модель замещения и априорные значения штрафов за гэпы, тем самым квантифицируя неопределенность выравнивания. Это особенно ценно, когда последующие анализы, такие как филогенетический вывод или функциональная аннотация, чувствительны к ошибкам выравнивания.