Анализ одноклеточной РНК-секвенирования с использованием мультиомики — Интегративное мультимодальное одноклеточное профилирование
Анализ одноклеточной РНК-секвенирования с использованием мультиомики интегрирует два или более молекулярных слоя — таких как экспрессия генов (scRNA-seq), доступность хроматина (scATAC-seq) или обилие поверхностных белков (CITE-seq) — измеренных одновременно или совместно профилированных в одних и тех же отдельных клетках. Согласовывая эти модальности в общем низкоразмерном пространстве, исследователи получают более богатое с точки зрения механизмов представление о клеточной идентичности, регуляторном состоянии и фенотипе, чем может предоставить любой отдельный метод.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Вызов пиков ChIP-seqБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ сравнить
- Мультиомный дифференциальный анализ экспрессии РНК-секвенированияБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →