Пиковое профилирование хроматина во времени методом ChIP-seq — Временное профилирование хроматина
Пиковое профилирование хроматина методом ChIP-seq во времени расширяет стандартный анализ иммунопреципитации хроматина (ChIP) и секвенирования (seq) на образцы, собранные в несколько моментов времени. Идентифицируя и сравнивая пики связывания белок-ДНК в течение временного измерения, метод выявляет, как оккупация транскрипционными факторами, модификации гистонов или связывание ремоделеров хроматина развиваются в ходе биологических процессов, таких как дифференцировка, циркадные циклы или ответ на стимул.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., ... & Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
- Haiminen, N., Karlebach, G., Kharchenko, P. V., & Lähdesmäki, H. (2018). TimeChIP: time-series peak calling for ChIP-seq data. Bioinformatics, 34(24), 4161–4167. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ ATAC-seqГенетика↔ сравнить
- Вызов пиков ChIP-seqБиоинформатика↔ сравнить
- Полногеномное ассоциативное исследование эпигенома (EWAS)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Дифференциальная экспрессия РНК-сек в динамикеБиоинформатика↔ сравнить
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →