Process / pipelineBioinformatics / omics

Анализ eQTL на уровне одиночных клеток — Специфическая для типа клеток генетическая регуляция экспрессии генов

Анализ eQTL на уровне одиночных клеток выявляет генетические варианты (eQTL), которые регулируют экспрессию генов специфическим для типа клеток образом путем совместного анализа профилей РНК-секвенирования одиночных клеток и генотипных данных доноров. В отличие от методов анализа eQTL на уровне совокупных образцов, он разрешает регуляторные эффекты, которые разбавляются или маскируются при смешивании типов клеток, позволяя обнаруживать варианты, эффекты которых ограничены определенными состояниями клеток или стадиями развития.

Открыть в MethodMindСкороВидеоСкороDownload slides

Читать метод полностью

Только для участников

Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.

Войти

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Источники

  1. Cuomo, A. S. E., et al. (2020). Single-cell RNA-sequencing of differentiating iPS cells reveals dynamic genetic effects on gene expression. Nature Communications, 11(1), 810. link
  2. Kim-Hellmuth, S., et al. (2020). Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues. Science, 369(6509), eaaz8528. link

Как цитировать эту страницу

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-eqtl-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Упоминается в

ScholarGateSingle-cell eQTL analysis (Single-cell Expression Quantitative Trait Loci Analysis). Получено 2026-06-15 из https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-eqtl-analysis · Набор данных: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026