Анализ одноклеточной РНК-секвенировки временных рядов — временная транскриптомика с разрешением на уровне отдельных клеток
Анализ одноклеточной РНК-секвенировки временных рядов с разрешением на уровне отдельных клеток фиксирует экспрессию генов в нескольких временных точках, чтобы выявить, как клеточные популяции возникают, переходят и расходятся в ходе динамических биологических процессов, таких как развитие, дифференцировка или прогрессирование заболевания. Комбинируя упорядочивание по псевдовремени, РНК-скорость и тестирование дифференциальной динамики, исследователи реконструируют временную траекторию отдельных клеток и выявляют изменения в регуляции генов, которые обусловливают биологические переходы.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ сравнить
- eQTL АнализБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
Упоминается в
Similar methods
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →