Выявление вариантов временных рядов — обнаружение продольных соматических мутаций

Выявление вариантов временных рядов — это биоинформатический конвейер, который идентифицирует и отслеживает геномные варианты (обычно соматические мутации) в нескольких образцах секвенирования, собранных от одного и того же субъекта в разные моменты времени. Он наиболее широко применяется в онкогеномике для реконструкции эволюции опухоли, мониторинга минимальной остаточной болезни и обнаружения появления терапевтически резистентных клонов. Путем совместного моделирования частот аллелей вариантов в темпоральном измерении метод отличает истинные соматические изменения от шума секвенирования и оценивает клональную динамику во времени.