Сетевой анализ РНК-секвенирования единичных клеток
Сетевой анализ РНК-секвенирования единичных клеток (scRNA-seq) расширяет стандартные рабочие процессы scRNA-seq путем построения и исследования сетей молекулярных взаимодействий — генных регуляторных сетей, сетей совместной экспрессии или графов клеточной коммуникации — на основе данных одноклеточной транскриптомики. Вместо того чтобы рассматривать каждый ген независимо, этот подход улавливает скоординированную активность генных цепей и межклеточных сигнальных путей внутри популяций клеток и между ними, обеспечивая системный взгляд на транскрипционную регуляцию с разрешением на уровне отдельных клеток.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ compare
- Сетевой анализ дифференциальной экспрессии РНК-секБиоинформатика↔ compare
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ compare
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ compare
- Анализ eQTL на уровне одиночных клетокБиоинформатика↔ compare
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ compare
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →