Сетевой анализ обогащения генных наборов

Сетевой анализ обогащения генных наборов (network GSEA) расширяет классический GSEA, включая биологические сети взаимодействий — такие как сети белок-белковых взаимодействий (PPI) или коэкспрессионные графы — в тест обогащения. Вместо того чтобы рассматривать каждый ген независимо, метод распространяет сигналы дифференциальной экспрессии по ребрам сети, позволяя совместно регулируемым или функционально связанным генам совместно поддерживать значимость генного набора. Результатом является биологически согласованная оценка обогащения, учитывающая топологию пути и зависимости между генами.