Анализ дифференциальной экспрессии генов в одноклеточной РНК-секвенировании
Анализ дифференциальной экспрессии генов в одноклеточной РНК-секвенировании (scRNA-seq DE) выявляет гены, уровни экспрессии которых значительно различаются между определенными группами отдельных клеток — такими как типы клеток, состояния заболеваний или условия лечения. В отличие от анализа РНК-секвенирования на уровне пула (bulk RNA-seq), который усредняет сигналы от миллионов клеток, анализ scRNA-seq DE работает с транскриптомом каждой отдельной клетки, обеспечивая детальную характеристику регуляции генов, специфичной для клеточных популяций, и гетерогенности внутри кажущихся однородными тканей.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Источники
- Butler, A., Hoffman, P., Smibert, P., Papalexi, E., & Satija, R. (2018). Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species. Nature Biotechnology, 36(5), 411–420. DOI: 10.1038/nbt.4096 ↗
- Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. (2014). Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biology, 15(12), 550. DOI: 10.1186/s13059-014-0550-8 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell RNA Sequencing Differential Expression Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/single-cell-rna-seq-differential-expression
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Кластерный анализСтатистика↔ compare
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ compare
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ compare
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ compare
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ compare
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →