Дифференциальная экспрессия РНК-сек в динамике — Временная транскриптомика

Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек в динамике выявляет гены, уровни экспрессии которых систематически изменяются в упорядоченных временных точках — например, во время развития, прогрессирования заболевания или ответа на лечение. В отличие от анализа ДЭ для двух условий, он явно моделирует временную структуру данных, улавливая динамические траектории экспрессии генов, а не единичный моментальный контраст. Специально для такого дизайна были разработаны такие инструменты, как maSigPro, ImpulseDE2 и splineTimeR.