Анализ обогащения путей временных рядов — динамическая активность путей во времени
Анализ обогащения путей временных рядов идентифицирует биологические пути, скоординированная активность генов в которых значительно изменяется в упорядоченных временных точках. Вместо того чтобы рассматривать каждую временную точку независимо, метод моделирует временную траекторию экспрессии генов в каждом пути и проверяет, активируются или подавляются ли целые биологические программы — а не только отдельные гены — зависимым от времени образом. Он широко используется в биологии развития, исследованиях ответа на лекарства и временных курсах инфекций.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Ernst, J., Nau, G. J., & Bar-Joseph, Z. (2005). Clustering short time series gene expression data. Bioinformatics, 21(Suppl 1), i159–i168. link ↗
- Cheng, J., Tegge, A. N., & Bhatt, D. L. (2014). A method for identifying and interpreting time-series pathway activity changes from gene expression data. Bioinformatics, 30(21), 3147–3154. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-pathway-enrichment-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ сравнить
- Мультиомиксный анализ обогащения путейБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ обогащения сигнальных путейБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Дифференциальная экспрессия РНК-сек в динамикеБиоинформатика↔ сравнить
Similar methods
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →