Анализ вариаций числа копий — Выявление и интерпретация CNV
Анализ вариаций числа копий (CNV) — это геномный конвейер для обнаружения регионов, где у индивидуумов содержится меньше или больше копий сегмента ДНК, чем в референсном геноме. CNV охватывают от килобаз до мегабаз и являются основным классом структурных вариаций, связанных с раком, нарушениями нейроразвития и популяционным разнообразием. Конвейер обычно обрабатывает интенсивности SNP-матриц или сигналы глубины прочтений полногеномного секвенирования, применяет алгоритмы сегментации, выявляет события усиления и потери, а также аннотирует их с использованием генных и клинических баз данных.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+9 more
Источники
- Redon, R., Ishikawa, S., Fitch, K. R., et al. (2006). Global variation in copy number in the human genome. Nature, 444(7118), 444–454. DOI: 10.1038/nature05329 ↗
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Полногеномное ассоциативное исследование эпигенома (EWAS)Биоинформатика↔ compare
- Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Биоинформатика↔ compare
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ compare
- Выравнивание последовательностейБиоинформатика↔ compare
- Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клетокБиоинформатика↔ compare
- Вызов вариантовБиоинформатика↔ compare
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →