ScholarGate
Ассистент
Process / pipelineBioinformatics / omics

Анализ обогащения сигнальных путей — Анализ обогащения биологических сигнальных путей

Анализ обогащения сигнальных путей (PEA) — это статистический подход, который принимает список интересующих генов или белков (обычно полученный в результате экспериментов по дифференциальной экспрессии или протеомике) и определяет, какие заранее определенные биологические сигнальные пути или функциональные наборы генов представлены чаще, чем можно было бы ожидать случайно. Путем сопоставления индивидуальных молекулярных изменений с курируемыми базами знаний о сигнальных путях, такими как KEGG, Gene Ontology или Reactome, PEA преобразует длинные списки генов в интерпретируемые биологические процессы, что делает его центральным инструментом в постанализе высокопроизводительных омиксных экспериментов.

Открыть в MethodMindСкороВидеоСкороСкачать слайды

Читать метод полностью

Только для участников

Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.

Войти

Карта метода

Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.

+ ещё 43

Источники

  1. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102
  2. Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140

Как цитировать эту страницу

ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis

Какой метод?

Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.

Сравнить рядом

Упоминается в

Байесовский поиск пиков ChIP-seqБайесовский анализ eQTLБайесовский анализ обогащения генных наборовБайесовский GWASБайесовский метаболомный анализБайесовский анализ обогащения сигнальных путейБайесовский протеомный анализБайесовский дифференциальный анализ экспрессии РНК-секвенированияДифференциальное эпигеном-широкомасштабное ассоциативное исследованиеДифференциальный анализ eQTLДифференциальный метаболомный анализДифференциальный анализ обогащения путейДифференциальный протеомный анализПолногеномное ассоциативное исследование эпигенома (EWAS)eQTL АнализАнализ обогащения генных наборов (GSEA)Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Анализ eQTL с использованием машинного обученияГенно-сетевой анализ обогащения с использованием машинного обученияМашинное обучение для анализа разнообразия микробиомаАнализ дифференциальной экспрессии РНК-сек с помощью машинного обученияАнализ одноклеточной РНК-секвенирования с использованием машинного обученияАнализ метаболомаМультиомиксное эпигеном-широкое исследование ассоциацийМультиомиксный анализ обогащения генных наборовМультиомный метаболомный анализАнализ многоомиксного разнообразия микробиомаМультиомиксный протеомный анализАнализ одноклеточной РНК-секвенирования с использованием мультиомикиСетевой анализ вариаций числа копийСетевое эпигеномное исследование ассоциаций (Network EWAS)Сетевой анализ eQTLСетевой анализ обогащения генных наборовСетевой GWASСетевой анализ метаболомикиСетевой анализ разнообразия микробиомаСетевой анализ дифференциальной экспрессии РНК-секСетевой анализ РНК-секвенирования единичных клетокПротеомикаАнализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Анализ eQTL на уровне одиночных клетокОдноклеточный анализ обогащения генных наборовОдноклеточный GWASАнализ метаболома одиночных клетокАнализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Анализ дифференциальной экспрессии генов в одноклеточной РНК-секвенированииАнализ обогащения генных наборов во времениАнализ метаболомики временных рядовАнализ временных рядов разнообразия микробиомаАнализ обогащения путей временных рядовДифференциальная экспрессия РНК-сек в динамикеАнализ одноклеточной РНК-секвенировки временных рядов
ScholarGatePathway Enrichment Analysis (Biological Pathway Enrichment Analysis). Получено 2026-06-15 из https://scholargate.app/ru/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis · Набор данных: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026