Анализ обогащения сигнальных путей — Анализ обогащения биологических сигнальных путей
Анализ обогащения сигнальных путей (PEA) — это статистический подход, который принимает список интересующих генов или белков (обычно полученный в результате экспериментов по дифференциальной экспрессии или протеомике) и определяет, какие заранее определенные биологические сигнальные пути или функциональные наборы генов представлены чаще, чем можно было бы ожидать случайно. Путем сопоставления индивидуальных молекулярных изменений с курируемыми базами знаний о сигнальных путях, такими как KEGG, Gene Ontology или Reactome, PEA преобразует длинные списки генов в интерпретируемые биологические процессы, что делает его центральным инструментом в постанализе высокопроизводительных омиксных экспериментов.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
+ ещё 43
Источники
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Alexa, A., Rahnenführer, J., & Lengauer, T. (2006). Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure. Bioinformatics, 22(13), 1600–1607. DOI: 10.1093/bioinformatics/btl140 ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Biological Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/pathway-enrichment-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ обогащения генных наборов (GSEA)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ метаболомаБиоинформатика↔ сравнить
- Сетевой анализ обогащения путейБиоинформатика↔ сравнить
- ПротеомикаБиоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq)Биоинформатика↔ сравнить
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →