Анализ вариаций числа копий во времени
Анализ вариаций числа копий (ВЧК) во времени — это конвейер вычислительной геномики, который характеризует амплификации и делеции хромосом в нескольких последовательных образцах от одного и того же индивидуума или опухоли. Сравнивая профили числа копий в последовательные моменты времени — такие как постановка диагноза, середина лечения, рецидив — он реконструирует клональную динамику и эволюционные траектории, обусловливающие геномную нестабильность, позволяя исследователям отслеживать, как субпопуляции растут, сокращаются или приобретают новые аберрации с течением времени.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Dentro, S. C., et al. (2021). Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes. Cell, 184(8), 2239-2254. link ↗
- Zaccaria, S., & Raphael, B. J. (2020). Accurate quantification of copy-number aberrations and whole-genome duplications in multi-sample tumor sequencing data. Nature Communications, 11(1), 4301. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/bioinformatics/time-series-copy-number-variation-analysis
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Анализ вариаций числа копийБиоинформатика↔ сравнить
- Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек (DE)Биоинформатика↔ сравнить
- Анализ вариаций числа копий на уровне отдельных клетокБиоинформатика↔ сравнить
- Вызов вариантовБиоинформатика↔ сравнить
Similar methods
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →