Дифференциальный анализ РНК-сек в одиночных клетках

Дифференциальный анализ РНК-сек в одиночных клетках (scRNA-seq) — это вычислительный конвейер, который сравнивает транскриптомные профили между биологическими условиями — такими как обработанные против необработанных, больные против здоровых или временные точки — с разрешением на уровне одиночных клеток. Он определяет, какие гены, типы клеток и состояния клеток изменяются между условиями, предоставляя механистическое понимание, которое не могут дать сравнения РНК-сек в совокупности. Подход сочетает кластеризацию, аннотацию типов клеток и статистическое тестирование, обычно используя агрегацию псевдосовокупностей для учета внутриобразцовой корреляции.