ScholarGate
Assistent

Yapay Zekâ

112 mètodes en aquesta família.

Destacats

Anàlisi d'admixtióAdmixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, StepheReconstrucció de l'Estat AncestralAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns ofAnàlisi d'ATAC-seqATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and cAnomenament de pics ChIP-seqChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based Teoria coalescentCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John KingmaAnàlisi de Variació del Nombre de CòpiesCopy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

Itinerari de lectura

Els mètodes fonamentals més referenciats d'aquest tema, en l'ordre en què es van desenvolupar — un punt de partida si tot just hi arribeu.

  1. Anàlisi de Variació del Nombre de Còpies1998–2006per Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
  2. Anàlisi d'Enriquiment de Vies2003–2005per Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
  3. Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)per Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
  4. Estudi d'associació a escala genòmica (GWAS)2005–2007per Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
  5. Estudi d'Associació a Escala d'Epigenoma (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)per Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
  6. Expressió Diferencial en RNA-seq2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)per Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
  7. Anàlisi de RNA-seq de cèl·lules individuals2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016per Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
  8. Anomenament de variants2009–2010 (modern high-throughput era)per Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
tots els mètodes d'aquest prestatge ↓

Tots els mètodes 112

Anàlisi d'admixtióReconstrucció de l'Estat AncestralAnàlisi d'ATAC-seqAnomenament de pics ChIP-seqTeoria coalescentAnàlisi de Variació del Nombre de CòpiesAnàlisi de cribratges CRISPRReconstrucció per Cryo-EMMuntatge de transcripció *de novo*Differential ChIP-seq peak callingAnàlisi diferencial de variacions del nombre de còpiesEstudi Diferencial d'Associació a Escala de l'EpigenomaAnàlisi diferencial d'eQTLAnàlisi Diferencial de MetabolòmicaAnàlisi diferencial d'enriquiment de viesAnàlisi diferencial de proteòmicaAnàlisi diferencial de l'ARNseq de cèl·lula únicaAnomenament diferencial de variantsEstudi d'Associació a Escala d'Epigenoma (EWAS)Estudi d'Associació a Nivell d'Epigenoma en Recerca EducativaAnàlisi eQTLEstadístiques F (FST)GCTAAnàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)Estudi d'associació a escala genòmica (GWAS)Estudi d'Associació de Genoma Complet en Recerca EducativaAnàlisi Hi-CTest HKACerca de perfils HMMERModelatge per homologiaMapeig IBDAnàlisi de blocs de DAAnàlisi de pics ChIP-seq assistida per aprenentatge automàticAnàlisi de Variacions del Nombre de Còpies Assistida per Aprenentatge AutomàticEstudi d'Associació a Nivell d'Epigenoma Assistit per ML (ML-EWAS)Anàlisi eQTL assistida per aprenentatge automàticAnàlisi d'enriquiment de conjunts de gens assistida per aprenentatge automàticGWAS assistit per aprenentatge automàticAnàlisi de metabolòmica assistida per aprenentatge automàticAnàlisi de diversitat del microbioma assistida per aprenentatge automàticAnàlisi d'enriquiment de vies assistida per aprenentatge automàticAnàlisi filogenètica assistida per aprenentatge automàticAnàlisi d'Expressió Diferencial d'ARNseq Assistida per Aprenentatge AutomàticAllinyament assistit per aprenentatge automàticAnàlisi d'ARNseq de cèl·lula única assistida per aprenentatge automàticMachine learning-assisted variant callingProva McDonald-Kreitman (MK)Anàlisi de metabolòmicaBinning metagenòmicAcoblament molecularEstudi d'associació epigenòmica multiòmicaAnàlisi Multi-òmica d'eQTLAnàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens MultiòmicaAnàlisi multiòmica de la metabolòmicaAnàlisi de la diversitat del microbioma multi-òmicAnàlisi d'Enriquiment de Vies MultiòmiquesAnàlisi Filogenètica Multi-òmicaAnàlisi proteòmica multiòmicaAnàlisi d'expressió diferencial multi-òmica amb RNA-seqAnàlisi Multiòmica de Single-Cell RNA-seqAnàlisi de variació del nombre de còpies basada en xarxesEpigenoma-Wide Association Study (EWAS) basat en xarxes (Network EWAS)Anàlisi d'eQTL basada en xarxesGWAS basat en xarxesAnàlisi Metabolòmica Basada en XarxesAnàlisi de la diversitat del microbioma basada en xarxesAnàlisi d'enriquiment de vies basat en xarxesAnàlisi Filogenètica Basada en XarxesAnàlisi de l'Expressió Diferencial d'RNA-seq basada en XarxesAnàlisi d'ARNseq de cèl·lules úniques basada en xarxesAnomenada Variant Calling Basada en XarxaAnàlisi d'Enriquiment de ViesModelització de FarmacòforsAnàlisi FilogenèticaContrastos Filogenètics IndependentsPuntuació de risc poligènicTopologia de la Xarxa d'Interaccions Proteïna-ProteïnaAnàlisi ProteòmicaQSARMapeig de loci de trets quantitatius (QTL)Velocitat de l'ARNExpressió Diferencial en RNA-seqSelection Sweep (Tajima's D)Alineació de seqüènciesAnàlisi de pics de ChIP-seq de cèl·lula únicaAnàlisi de la variació del nombre de còpies en cèl·lules individualsEstudi d'associació epigenòmica a cèl·lula única (scEWAS)Anàlisi d'eQTL de cèl·lula únicaSingle-cell Gene Set Enrichment AnalysisGWAS de cèl·lula únicaAnàlisi de Metabolòmica de Cèl·lula ÚnicaAnàlisi de la diversitat del microbioma a nivell cel·lularAnàlisi Filogenètica de Cèl·lules IndividualsAnàlisi de RNA-seq de cèl·lules individualsAnàlisi d'expressió diferencial d'ARNseq d'una sola cèl·lulaAlineació de seqüència d'una sola cèl·lulaAnomenament de variants en cèl·lules individualsAnàlisi de pic de ChIP-seq en sèries temporalsAnàlisi de variació del nombre de còpies en sèries temporalsEstudi de l'associació epigenòmica en sèrie temporalAnàlisi d'eQTL de sèries temporalsAnàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens en Sèries TemporalsAnàlisi de metabolòmica de sèries temporalsAnàlisi de la diversitat del microbioma en sèries temporalsAnàlisi d'Enriquiment de Vies en Sèries TemporalsAnàlisi Filogenètica de Sèries TemporalsAnàlisi proteòmica de sèries temporalsExpressió Diferencial d'ARN-seq en Sèries TemporalsAnàlisi d'ARN-seq unicel·lular de sèries temporalsAnàlisi de variants en sèrie temporalProva de Desequilibri de TransmissióAnomenament de variants

Més a Ciències de la vida

İstatistik 21Karar Bilimleri 7Ölçme & Psikometri 122Nedensellik & Kanıt 1