Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens en Sèries Temporals — Enriquiment Dinàmic de Vies en Punts Temporals
L'anàlisi d'enriquiment de conjunts de gens en sèries temporals (TS-GSEA, per les sigles en anglès) estén el marc clàssic de GSEA per detectar conjunts de gens coordinats biològicament — vies, termes de l'ontologia gènica o signatures curades — l'expressió col·lectiva dels quals canvia de manera significativa al llarg del temps. En lloc de comparar dues instantànies, modella la trajectòria temporal completa de l'expressió gènica per identificar quins programes funcionals s'activen, se suprimeixen o es remodelen dinàmicament durant un procés biològic com el desenvolupament, la resposta a un tractament o la progressió d'una malaltia.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Mapa de mètodes
El veïnat de mètodes relacionats — seleccioneu un node per explorar-lo.
Fonts
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Quin mètode?
Poseu aquest mètode al costat dels seus parents més pròxims i llegiu-los de costat a costat — la biblioteca disposa els llibres sobre la taula; la tria és vostra.
- Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)Bioinformàtica↔ compara
- Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens MultiòmicaBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi d'Enriquiment de ViesBioinformàtica↔ compara
- Expressió Diferencial en RNA-seqBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi de RNA-seq de cèl·lules individualsBioinformàtica↔ compara
- Expressió Diferencial d'ARN-seq en Sèries TemporalsBioinformàtica↔ compara
Similar methods
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →