Anàlisi de RNA-seq de cèl·lules individuals — scRNA-seq
L'anàlisi de la seqüenciació d'RNA de cèl·lules individuals (scRNA-seq) caracteritza l'expressió gènica amb la resolució de cèl·lules individuals, permetent el descobriment de tipus cel·lulars, estats i transicions que són invisibles en la transcriptòmica massiva. Partint de lectures de seqüenciació en brut, el flux de treball produeix una matriu de recompte cèl·lula-per-gen i procedeix a través del control de qualitat, normalització, reducció de dimensionalitat, agrupament no supervisat, anotació de tipus cel·lulars i una sèrie d'anàlisis posteriors com la inferència de trajectòries i l'expressió diferencial entre poblacions cel·lulars.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
+19 more
Fonts
- Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192 ↗
- Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002 ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)Bioinformàtica↔ compare
- Anàlisi d'Enriquiment de ViesBioinformàtica↔ compare
- Expressió Diferencial en RNA-seqBioinformàtica↔ compare
- Anàlisi d'eQTL de cèl·lula únicaBioinformàtica↔ compare
- Anomenament de variants en cèl·lules individualsBioinformàtica↔ compare
Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →