Anàlisi de variació del nombre de còpies basada en xarxes
L'anàlisi de variació del nombre de còpies (CNV) basada en xarxes integra dades de CNV a escala genòmica amb xarxes d'interacció biològica — com ara xarxes d'interacció proteïna-proteïna (PPI) o de vies metabòliques — per identificar regions funcionalment coherents, gens conductors i subxarxes alterades que la simple detecció de CNV no podria revelar. En propagar els senyals de CNV a través del graf de la xarxa, el mètode posa de manifest desequilibris coordinats en la dosi genòmica que convergeixen en funcions biològiques comunes, cosa que el fa especialment potent en genòmica del càncer i estudis de malalties rares.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Fonts
- Vandin, F., Upfal, E., & Raphael, B. J. (2012). De novo discovery of mutated driver pathways in cancer. Genome Research, 22(2), 375–385. DOI: 10.1101/gr.120477.111 ↗
- Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations across pathways and protein complexes. Nature Genetics, 47(2), 106–114. DOI: 10.1038/ng.3168 ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-copy-number-variation-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Anàlisi de Variació del Nombre de CòpiesBioinformàtica↔ compare
- Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)Bioinformàtica↔ compare
- GWAS basat en xarxesBioinformàtica↔ compare
- Anàlisi de l'Expressió Diferencial d'RNA-seq basada en XarxesBioinformàtica↔ compare
- Anàlisi d'Enriquiment de ViesBioinformàtica↔ compare
- Anomenament de variantsBioinformàtica↔ compare
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →