ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Anomenament de pics ChIP-seq — Anomenament de pics per Seqüenciació per Immunoprecipitació de Cromatina

L'anomenament de pics ChIP-seq és un pipeline computacional que identifica regions genòmiques on una proteïna d'interès —un factor de transcripció o una modificació d'histones— està enriquida, basant-se en lectures de seqüenciació d'experiments d'immunoprecipitació de cromatina. Converteix dades brutes de seqüenciació en un conjunt de llocs d'unió o modificació d'alta confiança a través del genoma, permetent l'anàlisi aigüent de la regulació gènica, l'estat de la cromatina i els mecanismes epigenètics.

Obre a MethodMindAviatVídeoAviatDownload slides

Llegeix el mètode complet

Només per a membres

Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.

Inicia la sessió

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Anomenament de pics ChIP-seq
Anàlisi d'ATAC-seqEstudi d'Associació a Es…Expressió Diferencial en…Alineació de seqüènciesAnàlisi de RNA-seq de cè…Anomenament de variantsAnomenament de pics ChIP…Differential ChIP-seq pe…Estudi Diferencial d'Ass…Anàlisi de pics ChIP-seq…

+3 more

Fonts

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ↗
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗

Com citar aquesta pàgina

ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side →

Citat per

Anomenament de pics ChIP-seq bayesiàDifferential ChIP-seq peak callingEstudi Diferencial d'Associació a Escala de l'EpigenomaEstudi d'Associació a Escala d'Epigenoma (EWAS)Anàlisi de pics ChIP-seq assistida per aprenentatge automàticAnàlisi Multiòmica de Single-Cell RNA-seqExpressió Diferencial en RNA-seqAlineació de seqüènciesAnàlisi de pics de ChIP-seq de cèl·lula únicaAnàlisi de pic de ChIP-seq en sèries temporals

Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →

ScholarGate — ChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Recuperat el 2026-06-15 de https://scholargate.app/ca/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Conjunt de dades: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026