Allinyament assistit per aprenentatge automàtic

L'alineament assistit per aprenentatge automàtic (machine learning, ML) utilitza models d'aprenentatge estadístic —incloent-hi xarxes neuronals profundes i models de llenguatge de proteïnes— per a calcular alineaments biològicament significatius entre seqüències de nucleòtids o aminoàcids. En aprendre patrons de substitució i restriccions estructurals a partir de grans corpus d'entrenament, aquests mètodes superen les matrius de puntuació clàssiques (p. ex., BLOSUM, PAM) en sensibilitat per a homòlegs remots i regions estructurals restringides, convertint-los en l'estat de l'art actual per a tasques d'alineament difícils en genòmica i proteòmica.