Anàlisi d'ATAC-seq
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) és un mètode per perfilat del paisatge d'accessibilitat de la cromatina a escala genòmica. Desenvolupat per Buenrostro i col·laboradors el 2013, ATAC-seq utilitza una transposasa hiperactiva per marcar regions de cromatina oberta i accessible, permetent una identificació ràpida i sensible d'elements reguladors del DNA. ATAC-seq s'ha convertit en una tècnica estàndard per caracteritzar paisatges reguladors gènics, descobrir elements reguladors específics de tipus cel·lular i inferir xarxes reguladores gèniques.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Fonts
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/genetics/atac-seq-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Anàlisi Hi-CGenètica↔ compare
- Velocitat de l'ARNGenètica↔ compare
Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →