Single-cell Gene Set Enrichment Analysis — scGSEA
L'anàlisi d'enriquiment de conjunts de gens en cèl·lules individuals (scGSEA) estén la GSEA clàssica a la resolució de cèl·lules individuals. En lloc de provar si un conjunt de gens està enriquit en una comparació a nivell de mostra, scGSEA assigna una puntuació d'enriquiment o activitat a cada cèl·lula, cosa que permet als investigadors mapejar l'activitat de vies a través de poblacions cel·lulars heterogènies, estats cel·lulars i trajectòries de desenvolupament capturades en dades d'ARSeq de cèl·lula única.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Mapa de mètodes
El veïnat de mètodes relacionats — seleccioneu un node per explorar-lo.
Fonts
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Quin mètode?
Poseu aquest mètode al costat dels seus parents més pròxims i llegiu-los de costat a costat — la biblioteca disposa els llibres sobre la taula; la tria és vostra.
- Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)Bioinformàtica↔ compara
- Anàlisi d'Enriquiment de ViesBioinformàtica↔ compara
- Expressió Diferencial en RNA-seqBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi de RNA-seq de cèl·lules individualsBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi d'expressió diferencial d'ARNseq d'una sola cèl·lulaBioinformàtica↔ compara
Citat per
Similar methods
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →