Process / pipelineBioinformatics / omics

Anàlisi de la diversitat del microbioma basada en xarxes

L'anàlisi de la diversitat del microbioma basada en xarxes integra la inferència de xarxes de coocurrència amb teoria de grafs amb les mètriques clàssiques d'alfa i beta diversitat per caracteritzar l'organització estructural de les comunitats microbianes. En lloc de tractar els tàxons com a entitats independents, el mètode modela les associacions microbianes per parells com a arestes en una xarxa, cosa que permet identificar tàxons clau, mòduls comunitaris i patrons d'interacció ecològica que els simples índexs de diversitat no poden detectar.

Obre a MethodMindAviatVídeoAviatDownload slides

Llegeix el mètode complet

Només per a membres

Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.

Inicia la sessió

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Fonts

  1. Friedman, J., & Alm, E. J. (2012). Inferring correlation networks from genomic survey data. PLoS Computational Biology, 8(9), e1002687. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002687
  2. Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538–550. DOI: 10.1038/nrmicro2832

Com citar aquesta pàgina

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Citat per

ScholarGateNetwork-based microbiome diversity analysis (Network-Based Microbiome Diversity Analysis). Recuperat el 2026-06-15 de https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis · Conjunt de dades: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026