Process / pipelineBioinformatics / omics

Anàlisi Filogenètica de Cèl·lules Individuals — Reconstrucció d'Arbres de Llinatge a Resolució de Cèl·lula Individual

L'anàlisi filogenètica de cèl·lules individuals reconstrueix arbres evolutius o de desenvolupament a partir de dades de seqüenciació de cèl·lules individuals, rastrejant com les cèl·lules individuals divergeixen d'un avantpassat comú. Aprofitant mutacions somàtiques, codis de barres introduïts per CRISPR o canvis en el nombre de còpies com a caràcters heretables, aquest mètode mapeja les relacions clonals dins de tumors, teixits en desenvolupament o repertoris immunitaris amb una resolució cel·lular sense precedents.

Obre a MethodMindAviatVídeoAviatDownload slides

Llegeix el mètode complet

Només per a membres

Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.

Inicia la sessió

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Fonts

  1. Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8
  2. Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859

Com citar aquesta pàgina

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateSingle-cell Phylogenetic Analysis (Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction). Recuperat el 2026-06-15 de https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis · Conjunt de dades: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026