ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Anàlisi de pics de ChIP-seq de cèl·lula única — Perfilació epigenòmica de scChIP-seq

L'anàlisi de pics de ChIP-seq de cèl·lula única és un pipeline bioinformàtic que identifica regions genòmiques enriquides per modificacions d'histones o unió de factors de transcripció en cèl·lules individuals. En perfilar els estats de la cromatina amb resolució de cèl·lula única, revela la heterogeneïtat epigenòmica oculta en experiments de ChIP-seq massius, permetent als investigadors mapejar paisatges reguladors a través de poblacions cel·lulars distintes dins d'una mostra de teixit complexa.

Obre a MethodMindAviatVídeoAviatDownload slides

Llegeix el mètode complet

Només per a membres

Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.

Inicia la sessió

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Fonts

  1. Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link
  2. Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link

Com citar aquesta pàgina

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateSingle-cell ChIP-seq peak calling (Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Recuperat el 2026-06-15 de https://scholargate.app/ca/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling · Conjunt de dades: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026