Cerca de perfils HMMER
La cerca de perfils HMMER identifica homòlegs de seqüències proteiques distants utilitzant models probabilístics de famílies de proteïnes, coneguts com a models ocults de Markov de perfil (HMM). Desenvolupat per Eddy i col·laboradors, aquest mètode captura patrons de variació de seqüències dins de famílies de proteïnes i detecta homòlegs amb molta més sensibilitat que les matrius de pesos de posició o l'alineament per parells.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Mapa de mètodes
El veïnat de mètodes relacionats — seleccioneu un node per explorar-lo.
Fonts
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/hmmer-profile-search
Quin mètode?
Poseu aquest mètode al costat dels seus parents més pròxims i llegiu-los de costat a costat — la biblioteca disposa els llibres sobre la taula; la tria és vostra.
- Reconstrucció per Cryo-EMBioinformàtica↔ compara
- Binning metagenòmicBioinformàtica↔ compara
- Acoblament molecularBioinformàtica↔ compara
Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →