Anàlisi d'enriquiment de vies basat en xarxes
L'anàlisi d'enriquiment de vies basat en xarxes integra xarxes d'interacció molecular —interaccions proteïna-proteïna, grafs de senyalització o xarxes de regulació gènica— amb mesures òmiques per identificar vies biològiques que s'alteren de manera coordinada en una condició determinada. A diferència dels enfocaments clàssics d'excés de representació o d'enriquiment de conjunts de gens que tracten els gens de les vies com a llistes independents, aquesta família de mètodes propaga senyals a través de les arestes de la xarxa, capturant la topologia de les interaccions i descobrint mòduls desregulats que l'enriquiment per llistes planes no detectaria.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Fonts
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
Compare side by side →Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →